Το Telegram χρησιμοποιεί κρυπτογράφηση διακομιστή-πελάτη για τυπικές συνομιλίες στο cloud, που σημαίνει ότι τα μηνύματα είναι ασφαλή καθώς μεταδίδονται και αποθηκεύονται στους διακομιστές του Telegram. Το Telegram χρησιμοποιεί πλέον κρυπτογράφηση από άκρο σε άκρο για να ενισχύσει την προστασία του απορρήτου των χρηστών στα Secret Chats, καθιστώντας τα μηνύματα αναγνώσιμα μόνο από τους προβλεπόμενους χρήστες.
Όχι, το Telegram δεν είναι κρυπτογραφημένο από άκρο σε άκρο από προεπιλογή και οι χρήστες πρέπει να ενεργοποιήσουν την υπηρεσία επιλέγοντας ένα πολύ ασφαλές όνομα χρήστη και κωδικό πρόσβασης. Παρόλο που οι Μυστικές συνομιλίες διαθέτουν κρυπτογράφηση από άκρο σε άκρο, οι συνηθισμένες συνομιλίες cloud έχουν κρυπτογράφηση διακομιστή-πελάτη.
Το Telegram έχει παράσχει λειτουργίες κρυπτογράφησης και ασφάλειας, ενώ το WhatsApp προσφέρει το ίδιο αλλά με διαφορετικό μηχανισμό κρυπτογράφησης. Το WhatsApp εφαρμόζει κρυπτογράφηση από άκρο σε άκρο σε όλες τις συνομιλίες του και δεν κάνει διαφοροποίηση μεταξύ τους ως προς το επίπεδο ασφάλειας.